Almuñécar zaczynał jako fenicka kolonia Sexi i do dziś niektórzy jej mieszkańcy nazywają siebie Sexitanos. Za czasów Maurów, Almuñécar rozkwitł jako rybackie miasto Al-Munakkab. Chociaż fenicka i rzymska historia dzielnicy była znana ze źródeł greckich i rzymskich, to jednak dopiero w latach 50-tych XX wieku odkryto znaczące dowody archeologiczne.
Fenicjanie po raz pierwszy założyli kolonię w Almuñécar około 800 roku p.n.e., która przez sześćset lat rozwinęła się w ważny port i miasto o nazwie Ex lub Sexi i dużym przemyśle solenia i uzdrawiania ryb, który był głównym dostawcą Grecji i Rzymu.
Dostarczali również cenną pastę rybną zwaną garum, wykonaną z jelit małych ryb w procesie fermentacji. Dowody archeologiczne pochodzą głównie z cmentarzy fenickich, wcześniejszej nekropolii Laurita na zboczu Cerro San Cristobal i późniejszej nekropolii w Punte de Noy. Obszerna kolekcja fenickich dóbr grobowych i innych artefaktów znajduje się w muzeum miejskim w zamku San Miguel i w “Cueva de Siete Palacios”.
“Rzymianie przybyli do południowej Hiszpanii w czasie drugiej wojny punickiej między Rzymem a Kartaginą w 218 r. p.n.e. w ramach kampanii mającej na celu opanowanie fenickich osad wzdłuż wybrzeża. W ciągu 700 lat rzymskich rządów kolonialnych miasto i jego przemysł rozwijały się pomyślnie, a w 49 r. p.n.e. gmina (jedno z 20 wyróżnionych wówczas miast w Hiszpanii) otrzymała tytuł Firmium Julium Sexi w uznaniu lojalności miasta wobec Rzymu.
Główne dowody na istnienie przemysłu solenia i peklowania ryb zostały odkryte podczas wykopalisk w latach 70-tych i 80-tych w rozległych ogrodach botanicznych Majuelo. XX wieku w rozległych ogrodach botanicznych Majuelo. Ujawniły one ogromny zakres odbudowy i modernizacji przemysłu pod wpływem rzymskim. Część terenu została starannie zachowana, co daje pewne wyobrażenie o wielkości przemysłu. Przemysł ten wymagał nie tylko dużych ilości ryb i soli morskiej, produkowanych w wielu miejscach wzdłuż wybrzeża, ale także stałego dopływu świeżej, bieżącej wody.
Aby sprostać temu zapotrzebowaniu, Rzymianie wybudowali w I wieku n.e. cztery mile wodociągu w dolinach Rio Seco i Rio Verde, w tym pięć znaczących akweduktów. Wszystkie, co niezwykłe, nadal stoją, a cztery z nich są nadal w użyciu po 2000 lat – zaadaptowane przez Maurów na przestrzeni wieków, aby służyć potrzebom nawadniania upraw. Rzymskie wodociągi również służyły miastu, a ostatnie wykopaliska w centrum miasta odkryły piąty akwedukt i łaźnie rzymskie.
Rzymianie prawdopodobnie jako pierwsi umocnili zamek św. Miguela, choć częste przebudowy zatarły większość bardzo rozległych fortyfikacji rzymskich. Obejmowały one most od zamku do “Peñon del Santo” z masywnym, wysokim na 100 stóp (30 m) łukiem, który przetrwał co najmniej do 1800 roku.
Tuż pod zamkiem od strony lądu znajduje się “Cueva de Siete Palacios”, co tłumaczy się jako “Jaskinia Siedmiu Pałaców”. W rzeczywistości jednak nie jest to jaskinia, lecz największa pozostałość po rzymskim pałacu, który do tej pory znajdował się w Almuñécar, przetrwała przez setki lat jako “mieszkanie socjalne”, aż do czasu, gdy “mieszkańcy jaskini” zostali ponownie zakwaterowani w latach siedemdziesiątych XX wieku. Dopiero wtedy okazało się, że jego prawdziwe pochodzenie jest oczywiste. Obecnie mieści się w nim muzeum miejskie.
Inne ważne rzymskie pozostałości w dzielnicy to rzymski most w Cotobro i rzymskie grobowce w kilku miejscach”.
Wraz z upadkiem Zachodniego Cesarstwa Rzymskiego w V wieku, narody germańskie, w tym Wizygotowie, przekroczyły Pireneje na Półwyspie Iberyjskim. Do 456 r. Wizygotowie stali się dominującą siłą i rozszerzyli swoje terytorium na południowo-zachodnie wybrzeże Morza Śródziemnego. Jednak pod ich rządami Hispania pozostała stosunkowo zromanizowana.
Wizygotowie przyjęli rzymską kulturę i język oraz utrzymali wiele starych rzymskich instytucji, chociaż duża część struktury gospodarczej upadła, a w Almuñécar przemysł przetwórstwa rybnego gwałtownie upadł. Biskupi katoliccy byli rywalami władzy i kultury wizygockiej do końca VI i początku VII wieku – okresu przejścia od arianizmu do katolicyzmu w królestwie wizygockim.
“Pierwsza arabska inwazja południowej Hiszpanii miała miejsce w 711 r. n.e. na Gibraltarze lub w jego pobliżu. W Almuñécar, miasto pamięta 15 sierpnia 755 roku, kiedy to Omeya Abd ar-Rahman I z Damaszku, założyciel Emiratu Kordoby, przybył z Afryki Północnej, aby założyć swoje arabskie królestwo.
Maurowie wprowadzili uprawę trzciny cukrowej i podtrzymali przemysł rybny; wiele ulic i budynków starego miasta zostało zagospodarowanych przez Maurów. Zamek pozostał twierdzą miasta i siedzibą rządu, a jego mury zostały wzmocnione. Dla tych, którzy nie mieli przychylności miejscowych władców, zbudowano rozległe lochy, ale także łaźnie dla potrzeb elity społecznej.
Krzyż na Peñon Del Santo, skała przy starym wejściu do portu, oznacza klęskę Arabów, ich poddanie się w Almuñécar i powrót chrześcijaństwa w 1489 roku, po którym nastąpił wiek współżycia”.
Po przywróceniu chrześcijańskich rządów pojawiły się nowe stwierdzenia architektoniczne – na przykład w 1557 roku rozpoczęto budowę nowego kościoła, który został ukończony według najnowszego projektu w 1600 roku, pierwszego kościoła w stylu barokowym w prowincji Granada.
Stare miasto zostało również schrystianizowane (a może poganizowane – przez samą boginię płodności), jak w budynku fontanny wodnej na Calle Real (Royal Street), datowanym na 1559 r. i z cyprem królewskim powyżej, ale w tym czasie z wykorzystaniem istniejącego rzymskiego wodociągu z Las Angosturas, zainstalowanego po raz pierwszy 1500 lat wcześniej.
Zamek został ponownie gruntownie przebudowany i objęty patronatem San Miguel. Został odbudowany i mocno ufortyfikowany przez króla chrześcijańskiego Karola III i ostatnio broniony (przez Francuzów) w wojnach napoleońskich. Tylko jedna wieża została częściowo zniszczona, ale również większość budynków wewnętrznych. Było to dzieło załogi brytyjskiego statku HMS Hyacinth, działającego we współpracy z hiszpańskimi partyzantami z Nerja 27 maja 1812 roku. Spowodowali oni ucieczkę francuskiego garnizonu, a następnie próbowali uczynić zamek bezużytecznym, ale z niewielkim powodzeniem – ponieważ proch był wilgotny. Zamek został jednak ukończony jako twierdza wojskowa i po wybuchu cholery w 1830 r. zamek stał się cmentarzem miejskim, z którego w 1986 r. został wyczyszczony, aby umożliwić jego restaurację, która trwa do dziś.
W 1562 roku hiszpańska flota zatonęła podczas sztormu w zatoce La Herradura.
